El archipiélago de Juan Fernández tiene la mayor densidad de especies endémicas de flora del mundo; posee 0.98 especies por kilómetro cuadrado. Tiene 131 especies que sólo existen en sus islas, revelando un 62% de endemismo. Además de la flora destacan las aves, entre su avifauna habitan 3 especies y 4 subespecies únicas, entregándole al archipiélago una concentración de un 45% de aves endémicas.
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